嫁接辣椒的時候,可以使用半栽培辣椒、野生辣椒作爲砧木,對於甜椒類的辣椒,砧木可使用的品種爲土佐綠B,對於尖椒類的品種,砧木可用PFR-S64、PFR-K64以及LS279。辣椒嫁接也可以選擇其他的茄科植物上,比如茄子等。在準備嫁接前,要先消毒剪刀,這樣植株不容易感染病菌。