檸檬樹在生長期間修剪，主要在夏季花期時進行修剪。檸檬樹以輕疏長放爲主，保持每年有足夠的花量增加產量。修剪上配置副主枝和側枝，宜對長勢旺盛的直立枝梢採用拉、撐的方法，及時塗抹愈傷防腐膜保護傷口，才能多生長開花。
檸檬樹要注意控制冬梢，保護春梢的生長，留夏秋的梢生長，修剪後注意拉枝，增加內膛枝的透光性，滿足樹形樹冠的發展要求。
