土壤空氣雖然來源於大氣,但在組成上卻與大氣不同。土壤空氣中氧的含量低於大氣,這是由於根呼吸,耗氧微生物的繁殖和生理活動消耗了土壤中的O2所造成的。根呼吸和微生物的生命活動也產生了大量CO2造成土壤中CO2的濃度高於大氣。土壤中的水汽遠較大氣為高,經常達到飽和狀態,土壤中水分經常向大氣中擴散,就形成了土壤水分的蒸發。通氣不良的土壤還可產生還原性氣體,如H2S、CH4等。