危害牡丹的疾病很多，其中红斑病的情况最为严重，患病后叶子会出现斑点，之后连成片，影响植株开花，还可能导致其枯萎，通常要用多菌灵或百菌清防治。它的常见害虫是蛴螬，也就是金龟子的幼虫，主要危害植株根茎，需要用辛硫磷溶液灌根将其消灭。
