黃金萬年草的主要病害是煤煙病，黑腐病。其中感染煤煙病時要摘除病葉，還要噴灑殺菌的藥劑。若是黑腐病，要將腐爛的部分處理掉，還要噴灑多菌靈或者百菌清，三五天就用一次，直到變好爲止。還有一些蟲害，如小黑飛，介殼蟲，發現時都要噴灑殺蟲劑徹底消滅。另外，要加強通風，多曬太陽，避免植株再次感染。
