修剪西紅柿的時候，若是單幹整枝的話，是等到側芽生長到約4-7cm時剪除，主幹是需要保留的，這樣修剪可節省養分，果實才能生長更多。若是雙幹整枝的話，應等花序長出後把花序下第一個側枝保留，其餘的都要修剪掉，並且還要做好綁蔓工作。另外，秧苗上的老枝和枯枝也是可以修剪掉的。
