微孔草耐寒，耐旱，喜強光照。生長於高寒草甸、林地、灌叢和次生植被中，常與1年生作物或1-2年生野生植物混合生長形成植物羣落。這些羣落與環境之間未達到平衡，處於不穩定狀態，羣落內部物種成分常發生變化。隨原有種的消失，新物種的入侵，微孔草的數量逐步減少，有時從羣落中消失。
微孔草在植物羣落中通常不是優勢種，其優勢度處在7%-15%。它作爲次生演替初始階段植被成員而佔據有效空間，成爲高山地區次生植被中的生態適宜種而生存。
