碗蓮有無性繁殖和有性繁殖兩種。有性繁殖即用種子直播，但容易產生變異，在育種上應用較多；日常繁殖以無性繁殖爲主，即通過碗蓮的苫芽發育成新的個體。長江流域一般在清明前後翻盆分藕，注意切勿損傷頂芽。種藕至少要保留兩段藕身，尾部留節。留有節的種藕栽後藕身腐爛緩慢，能爲荷花發芽展葉提供足夠的養分。通常碗蓮種植在小鉢內，受營養條件的限制，繁殖係數較低。爲了加速繁殖，可種在較大的鉢內，促使地下莖多分枝，提高繁殖率。
