種子優劣直接影響幼苗和盆花的質量，因此對瓜葉菊的繁殖首先要選好結籽的母株，即花色好、無病蟲害的健壯植株爲母株，不同花色的品種應分別放置在適生的環境條件下養護管理，以免相互傳粉雜交變異。
在開花結籽期，適當疏去植株葉子1/3，選留優質葉片2/3，以利光合作用，減少養分的消耗，促使結實飽滿。因瓜葉菊成熟期不一，應分期分批採收成熟種子，採收後的種子必須晾乾，清除雜質，貯存在陰涼乾燥處。
